135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2642 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
309 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  97.39 
 
 
313 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  95.5 
 
 
318 aa  613  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  96.41 
 
 
318 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  66.9 
 
 
278 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  69.77 
 
 
292 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  65.85 
 
 
278 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  64.91 
 
 
289 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  45.31 
 
 
262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  42.34 
 
 
264 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
279 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  35.14 
 
 
263 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
272 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.47 
 
 
263 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  33.2 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
246 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  34.27 
 
 
245 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  30.52 
 
 
247 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  30.52 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  29.47 
 
 
200 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  29.66 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 
390 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
265 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 
299 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  22.43 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.88 
 
 
300 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.88 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  31.68 
 
 
238 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
258 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  21.09 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  31.03 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  21.09 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.51 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.51 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.51 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.51 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.91 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  22.66 
 
 
380 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  35.96 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  33 
 
 
275 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  33 
 
 
275 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  29.06 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  33.62 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
261 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  25.94 
 
 
252 aa  46.6  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
261 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
235 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
240 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.97 
 
 
425 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.28 
 
 
265 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
291 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.84 
 
 
285 aa  45.8  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  22.17 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  29.89 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11931  Alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.18 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  24.34 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  23.88 
 
 
453 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  36.63 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  21.09 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  35.29 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42354  predicted protein  39.71 
 
 
631 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0774885  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  20.7 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  29.94 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 
239 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  26.63 
 
 
487 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.36 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>