More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5127 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  77.91 
 
 
254 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  43.43 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  42.04 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 
254 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  42.62 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  38.59 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  39 
 
 
265 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  42.74 
 
 
272 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  37.9 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  38.89 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  39.08 
 
 
255 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  36.75 
 
 
271 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
257 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  37.29 
 
 
257 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  34.73 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  36.33 
 
 
263 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 
258 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  32.52 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  32.52 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  32.52 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  32.52 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  32.52 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  32.52 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  32.52 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  32.52 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  31.3 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  32.52 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  32.77 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 
271 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  31.3 
 
 
247 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  32.77 
 
 
246 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
278 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  30.67 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  30.52 
 
 
271 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  29.41 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  30.71 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  30.4 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  30.9 
 
 
253 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
283 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  31.8 
 
 
262 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  31.89 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  29.83 
 
 
246 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  29.83 
 
 
246 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  27.34 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
292 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  30.17 
 
 
250 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0449  carboxylesterase  28.15 
 
 
246 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
241 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  31.97 
 
 
252 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  28.88 
 
 
253 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
288 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
287 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  29.23 
 
 
306 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.83 
 
 
290 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1037  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
298 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3124  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
281 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  27.31 
 
 
407 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
253 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
256 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  31.3 
 
 
255 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  28.99 
 
 
238 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.92 
 
 
736 aa  98.6  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  30.04 
 
 
274 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  29.96 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  28.11 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  28.11 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.63 
 
 
736 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  28.11 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  29.41 
 
 
274 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  27.76 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  25.53 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  30.16 
 
 
257 aa  95.5  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
299 aa  95.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13780  esterase/lipase  36.2 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0795828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  29.24 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0547  putative carboxylesterase  31.15 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  27.48 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  27.31 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5263  hypothetical protein  25.87 
 
 
303 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  27.31 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  27.31 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  24.51 
 
 
296 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1813  putative carboxylesterase  32.86 
 
 
250 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  26.91 
 
 
271 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  26.67 
 
 
733 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  30.41 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  24.7 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  24.69 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  24.69 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  28.65 
 
 
523 aa  76.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2020  carboxylesterase precursor  24.54 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  24.14 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0393  esterase/lipase-like protein  25.7 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000104538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>