More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1471 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  82.48 
 
 		 233 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  68.24 
 
 		 233 aa  325  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  66.52 
 
 		 233 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  41.77 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  36.44 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  39.2 
 
 		 235 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  29.65 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  37.44 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  37.84 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  36.2 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  39.38 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  41.18 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  37.56 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  40.64 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  40.64 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  34.48 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  32.34 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  38.29 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  30.85 
 
 		 267 aa  98.6  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  34.86 
 
 		 264 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  32.33 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  32.33 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  32.33 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 265 aa  91.7  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  30.64 
 
 		 277 aa  88.6  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.63 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  32 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  25.11 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.46 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  31.98 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  35.68 
 
 		 308 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.8 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.36 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  32.11 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  32.95 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  32.93 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  34.54 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  34.73 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.28 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.09 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.09 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.91 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.09 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.49 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  30.96 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.15 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  32.21 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.96 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.31 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.72 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  28.38 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  34.48 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>