More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0513 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  74.67 
 
 
251 aa  357  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  74.67 
 
 
251 aa  357  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  74.24 
 
 
238 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  56.31 
 
 
230 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 
239 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
234 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 
259 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  31.33 
 
 
233 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  33.18 
 
 
236 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  31.03 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  28.51 
 
 
239 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
235 aa  85.1  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  32.18 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  22.82 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.71 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.49 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  28.44 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3138  hypothetical protein  28.95 
 
 
250 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.766563  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 
239 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
262 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
275 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  21.31 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  50.88 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.11 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  48.08 
 
 
284 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  22.65 
 
 
279 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.81 
 
 
288 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
265 aa  59.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
285 aa  58.9  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  27.96 
 
 
271 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  23.37 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  29.27 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1252  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  38.1 
 
 
316 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0308  alpha/beta fold family hydrolase, putative  24.46 
 
 
272 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13301  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  38.1 
 
 
313 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
291 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 
314 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13451  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  36.51 
 
 
313 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3646  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 
136 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  25.79 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  27.91 
 
 
263 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  23 
 
 
421 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  24.51 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 
308 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  30.48 
 
 
279 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
279 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
279 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  30.48 
 
 
279 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  28.28 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 
363 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  30.48 
 
 
279 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.76 
 
 
343 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  27.96 
 
 
266 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.49 
 
 
297 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
316 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
303 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  26.15 
 
 
269 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
288 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
363 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  30.48 
 
 
279 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  22.33 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
261 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.64 
 
 
259 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
263 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.12 
 
 
425 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 
287 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 
287 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
271 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 
287 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 
314 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.75 
 
 
246 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  29.52 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 
288 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1452  hydrolase, alpha/beta fold family  27.42 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000259756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.57 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>