More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00281 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  38.86 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  26.41 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  24.78 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  27.84 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  27.31 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  25.81 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  24.15 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  23.65 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1973  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.24 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.53 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  26.59 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  24.86 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  25.15 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  24.76 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  23.47 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  27.27 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  25.29 
 
 		 393 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  24.72 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  23.61 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  23.2 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  23.61 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.28 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  23.61 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  24.32 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.73 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.28 
 
 		 372 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  26.98 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  24.38 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  25.37 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.84 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  22.8 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  22.52 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 268 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  25.61 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  22.66 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.97 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  23.6 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 306 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 288 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 		 267 aa  52  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 325 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 271 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  26.55 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  28 
 
 		 387 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0720  alpha/beta hydrolase fold protein  24.49 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.86668  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.15 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.65 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  21.81 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0276  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  24.72 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>