More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6262 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  56.31 
 
 		 229 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  54.02 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  54.02 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  54.02 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  34.5 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  34.38 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  33.62 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  32.9 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  30.26 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  28.76 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  28.36 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  33.15 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  29.85 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  28.04 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 271 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 345 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.86 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  27.54 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.81 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.81 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25.14 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 297 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.09 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.85 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.02 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  24.45 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.43 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 340 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 309 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  27.22 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.1 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  27.27 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.84 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3646  alpha/beta hydrolase fold protein  38.03 
 
 		 136 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 275 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>