More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6785 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  45.89 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  45.85 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  42.79 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  46.93 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  42.17 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  44.5 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  41.78 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  36.91 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  39.82 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 259 aa  134  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  27.68 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  35.19 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  37.93 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  36.25 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  36.18 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  31.2 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  31.2 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  31.17 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  30.05 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.65 
 
 		 277 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  30.57 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  36.87 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.14 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.91 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.37 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.28 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.45 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.14 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  26.11 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  23.77 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  29.63 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.43 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  24.85 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  23.01 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.29 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 		 256 aa  62  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 270 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 301 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  25.93 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  25.19 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.34 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.04 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  31.95 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.76 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  19.92 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3646  alpha/beta hydrolase fold protein  36.96 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>