More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4141 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  100 
 
 
233 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  82.48 
 
 
234 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  67.67 
 
 
233 aa  330  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  69.83 
 
 
233 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  42.79 
 
 
235 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  38.43 
 
 
239 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  39.79 
 
 
239 aa  148  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  41.4 
 
 
259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  28.44 
 
 
227 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  41.92 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  34.84 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
237 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
237 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  39.59 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  40.23 
 
 
263 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  40.23 
 
 
263 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  34.5 
 
 
230 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  31.5 
 
 
267 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  31.33 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  33.5 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
265 aa  99  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
264 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
239 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  31.6 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  31.6 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  31.6 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.53 
 
 
263 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
264 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 
261 aa  88.6  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  30.46 
 
 
277 aa  88.6  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.4 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  37.65 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  33.52 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
263 aa  82  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  26.41 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  30.22 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  33.53 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.65 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  32.02 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.21 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.66 
 
 
289 aa  75.1  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.69 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  34.55 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  33.71 
 
 
393 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  29.85 
 
 
263 aa  72  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.9 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  33.52 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.25 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  31.22 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.65 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
301 aa  68.6  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 
261 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.36 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.16 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.11 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  25.54 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.11 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.11 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.77 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  26.6 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  31.82 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.89 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>