234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1718 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  37.07 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  31.5 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 234 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  30.05 
 
 		 235 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 		 239 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  29.33 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  24.62 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  31.5 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  31.5 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  31.5 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  25.93 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  30.26 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  32.18 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30.5 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.89 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  22.33 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.23 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  26.04 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  24.76 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  22.09 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  22.71 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.53 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  27.75 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  26.06 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.95 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  23.39 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  23.4 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.73 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  22.67 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  24.74 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  25.99 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  22.61 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  24.76 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  27.59 
 
 		 7149 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  22.41 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  26.94 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.68 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  23.32 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  26.53 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 340 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 340 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  34.18 
 
 		 425 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  21.81 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  21 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.37 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 386 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  22.65 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  22.73 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  23.15 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  25.25 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.33 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  23.15 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>