More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1360 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  59.49 
 
 
239 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  58.91 
 
 
237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 
237 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 
245 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
241 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  39.06 
 
 
233 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  38.12 
 
 
235 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  37.07 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  35.74 
 
 
239 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
234 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  39.06 
 
 
236 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
233 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  36.32 
 
 
239 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  30 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  37.24 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  34.98 
 
 
230 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
259 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.4 
 
 
263 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.21 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  31.22 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
280 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  30.77 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  29.66 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  29.66 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.57 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  29.24 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.82 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  26.27 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.44 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.46 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  32.11 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.28 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.21 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.9 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  25.28 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.71 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.71 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
390 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.51 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  24.6 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.07 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
366 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.62 
 
 
262 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.49 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.49 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.49 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 
256 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
264 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
265 aa  62.4  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.81 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>