More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1781 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1781  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
260 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  34.26 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  37.61 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.09 
 
 
369 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35 
 
 
346 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
562 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
327 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.25 
 
 
372 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  30.25 
 
 
328 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  30.25 
 
 
273 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.25 
 
 
273 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  34.45 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  31.62 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
324 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.62 
 
 
371 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.83 
 
 
279 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.41 
 
 
328 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
250 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
323 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
270 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.17 
 
 
370 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  25.76 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  23.42 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  22 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.85 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
277 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
323 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  28.21 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.08 
 
 
292 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  32.26 
 
 
284 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
300 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  28.83 
 
 
571 aa  56.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.94 
 
 
368 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.94 
 
 
368 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
283 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
283 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
309 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.94 
 
 
370 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  26.18 
 
 
556 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  32.69 
 
 
239 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.94 
 
 
368 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  30.71 
 
 
295 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 
322 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  32.69 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.17 
 
 
370 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  30.83 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
310 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
346 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
226 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.24 
 
 
371 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  29.36 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.33 
 
 
371 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>