48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0810 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  99.67 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  99.67 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  99.67 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  99.67 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  99.67 
 
 
299 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  99.67 
 
 
299 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  99.67 
 
 
299 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  99.67 
 
 
299 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  97.32 
 
 
299 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  97.32 
 
 
299 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  99.28 
 
 
278 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  99.28 
 
 
278 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  99.28 
 
 
278 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  99.28 
 
 
278 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  73.84 
 
 
300 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  77.5 
 
 
300 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  77.29 
 
 
300 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  77.09 
 
 
300 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  76.73 
 
 
300 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  76.73 
 
 
300 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  47.25 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  47.89 
 
 
287 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  49.39 
 
 
258 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  48.7 
 
 
295 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  48.33 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  43.32 
 
 
300 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  41.92 
 
 
296 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  41.54 
 
 
272 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  43.17 
 
 
300 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 
295 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 
295 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  40.44 
 
 
294 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  41.28 
 
 
294 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 
295 aa  215  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  39.58 
 
 
293 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  31.98 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  24.77 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  25.71 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>