More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5478 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5478  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 335 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1974  alpha/beta hydrolase fold protein  60.85 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1792  alpha/beta hydrolase fold  59.57 
 
 		 316 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0957565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.85 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.91 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  21.56 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  29.13 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  24.73 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  26.64 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  28.35 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  21.54 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  24.45 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.6 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  23.47 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.35 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  32.77 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  21.86 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  26.72 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  27.27 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  26.07 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  26.07 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>