215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1880 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  100 
 
 		 277 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  73.65 
 
 		 277 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  74.53 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  74.53 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  73.05 
 
 		 279 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  74.81 
 
 		 277 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  66.15 
 
 		 285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  65.76 
 
 		 285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.8 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  35.93 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  35.93 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  29.23 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  29.17 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  34.07 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  35.65 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  27.47 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  30 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  36.68 
 
 		 326 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  32.22 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  28.78 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  26.52 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  28.17 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  33.93 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  33.49 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  32.06 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  32.49 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  32.18 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  33.5 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  26.98 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  30.38 
 
 		 333 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  30.33 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  32.84 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  28.57 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  30.99 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  27.92 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  36.84 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  26.17 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  35.75 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  26.05 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  30.81 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  22.71 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.45 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  27.16 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  34.07 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  36.05 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.62 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl606  putative hydrolase  21.24 
 
 		 340 aa  52.8  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  31.06 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  31.05 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  27.18 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  24.6 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.58 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  36.51 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  29.94 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  29.9 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  43.53 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  28.36 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.8 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  31.91 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  37.84 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  37.84 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  37.84 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  37.84 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  37.84 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  24.87 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  20.17 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>