71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2857 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  100 
 
 
296 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  36.82 
 
 
277 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  34.39 
 
 
300 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.55 
 
 
285 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  33.81 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  35.54 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  29.96 
 
 
287 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  24.1 
 
 
288 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  32.74 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  31.69 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  29.77 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  32.95 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  36.73 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  24.62 
 
 
288 aa  85.5  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  33.94 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  29.83 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  29.83 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  34.96 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  32.7 
 
 
363 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  22.96 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  29.74 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  34.3 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  34.85 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  31.75 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  34.4 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  22.57 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  33.09 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  30.95 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  36.67 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  22.51 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  30.67 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  34.52 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  25.81 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  26.52 
 
 
301 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  36.2 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  26.67 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  28.95 
 
 
151 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  25.35 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  25.82 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  31.53 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
257 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  31.74 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  30.33 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
245 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  20.56 
 
 
283 aa  45.8  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  31.82 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  31.3 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  24.14 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  24.42 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  20.35 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  21.17 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  21.17 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
288 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  26.7 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  21.76 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  32.17 
 
 
294 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  31.3 
 
 
294 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2593  alpha/beta hydrolase  22.9 
 
 
234 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00594196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>