21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02220 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.33 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  29.22 
 
 		 302 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.95 
 
 		 296 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  31.76 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  30.87 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.81 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  29.41 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  30.32 
 
 		 326 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  28.48 
 
 		 343 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  27.54 
 
 		 326 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  28.67 
 
 		 308 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  26.14 
 
 		 301 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  29.58 
 
 		 294 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  26.35 
 
 		 287 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  22.07 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  29.33 
 
 		 333 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  35.62 
 
 		 326 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  40.62 
 
 		 320 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  40.62 
 
 		 320 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  39.29 
 
 		 305 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>