215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0071 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  44.12 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  41.08 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  37.16 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  42.25 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  34.71 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  38.36 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  32.46 
 
 		 343 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  38.1 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  30.53 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  40.87 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.32 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  34.26 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  37.99 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  35.65 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  33.33 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  34.78 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  35.21 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  33.6 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  27.64 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.92 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  23.05 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  32.09 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  35.27 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  35.92 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  31.17 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  35.44 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  37.29 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  36.2 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  31.51 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  33.18 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  25.26 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  23.13 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  29.79 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  24.55 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  28.77 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  25.73 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  26.09 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  28.16 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  29.11 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  26.87 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  23.23 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  24.33 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  23.38 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30.11 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1653  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0637812  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  26.85 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  24.71 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  27.83 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  27.83 
 
 		 277 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 352 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 276 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 276 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2389  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 277 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0360603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  36.11 
 
 		 340 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  36.11 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  33.66 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  36.11 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  36.11 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  36.11 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  36.11 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  36.11 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  33.65 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  31.91 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  31.91 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  30.17 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.57 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.92 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  24.77 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>