187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4371 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  74.91 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  39.86 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  41.36 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  42.36 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  32.56 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  35.61 
 
 		 295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  38.86 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  40.51 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.49 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  40.15 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.18 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  33.33 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  42.04 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  32.37 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  41.15 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  32.59 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  33.99 
 
 		 279 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  35.27 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  33.8 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  33.62 
 
 		 300 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  34.98 
 
 		 285 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  30.58 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  24.37 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  34.83 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  33.33 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  33.82 
 
 		 277 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  33.07 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  36.84 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  30.7 
 
 		 363 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  32.27 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  32.34 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  22.58 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  22.93 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  25.23 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  25.49 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  33 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  25.29 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  22.3 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  29.87 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 288 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  26.25 
 
 		 322 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  31.87 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.75 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  35.78 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  28.71 
 
 		 408 aa  50.4  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  37.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  39.13 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  38 
 
 		 274 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 268 aa  49.3  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.57 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.65 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  37.63 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.89 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  37.63 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1567  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0838089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.66 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.66 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  29.81 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.66 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 269 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.76 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  32.71 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 273 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  34.21 
 
 		 277 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  36.54 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  31.69 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  38.64 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>