42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0906 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  100 
 
 		 344 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  59.61 
 
 		 324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  49.07 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  48.18 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  50.19 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  35.69 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  38.8 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  35.58 
 
 		 304 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  38.04 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  38.37 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  34.04 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  34.04 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  35.16 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  32.92 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.44 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  31 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  30.95 
 
 		 282 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  29.49 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  36.11 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  26.64 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  30.63 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  30.5 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  36.44 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  32.02 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  27.98 
 
 		 192 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  31.9 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  31.07 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  25.25 
 
 		 216 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  29.25 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  27.27 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.53 
 
 		 225 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  29.57 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  27.75 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0450  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.82 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  27.13 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  40.96 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  26.15 
 
 		 533 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.147109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  28.64 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  36 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  26.89 
 
 		 189 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>