More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1203 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  100 
 
 		 314 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  56.51 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  45.34 
 
 		 326 aa  238  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  52.01 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  57.67 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  43.27 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  29.88 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  25.45 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  27.53 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  27.53 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  27.53 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.57 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  23.31 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  26.09 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  29.73 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  28.74 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  27.35 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  26.92 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  26.57 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  26.92 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  26.92 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  26.92 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  26.92 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  26.92 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  26.92 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.42 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.21 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  26.92 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  28.87 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.82 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  22.37 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  27.89 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  29.33 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  26.24 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  26.52 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  25.91 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  33.49 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.96 
 
 		 622 aa  67.8  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.88 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  26.56 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  25.27 
 
 		 648 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.63 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  28.04 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  26.36 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  31.9 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  32.31 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.23 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  27.07 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  34.85 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  26.46 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  21.61 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  29.49 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  23.37 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  25.91 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.26 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  30.81 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  20.31 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.22 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  23.37 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.77 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  26.64 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  29.17 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  25 
 
 		 759 aa  60.5  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0804  putative aminopeptidase protein  27.36 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  24.22 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.39 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  28.05 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  24.87 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  26.55 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.23 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  26.72 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  30.2 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  30.57 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  27.15 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.78 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.2 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  24.87 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  24.48 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  26.69 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  30.57 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  29.84 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  22.55 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  24.62 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.53 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  28.32 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  27.3 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.57 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  28.37 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  24.48 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.29 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  20.75 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>