172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2765 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  100 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  67.57 
 
 
263 aa  323  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  60.25 
 
 
255 aa  279  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  52.92 
 
 
265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0292  putative hydrolase  50.21 
 
 
263 aa  238  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  50.2 
 
 
339 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6824  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  52.56 
 
 
283 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6175  hypothetical protein  48.26 
 
 
279 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4984  peptidase S15  43.59 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0444  hypothetical protein  34.47 
 
 
287 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  28.23 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  36.11 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  26.09 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  30.37 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  32.43 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.82 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.63 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  31.15 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  29.3 
 
 
294 aa  72  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  30.4 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.74 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  32.94 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  32.37 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.22 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  25.85 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  27.31 
 
 
467 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
319 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  27.49 
 
 
306 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  26.39 
 
 
309 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  23.48 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  24.1 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  26.96 
 
 
319 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  26.96 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.36 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  26.11 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 
319 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  29.95 
 
 
296 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  27.73 
 
 
278 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  28.24 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  22.66 
 
 
313 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  28.86 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  28.95 
 
 
314 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.57 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  31.22 
 
 
314 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  26.83 
 
 
319 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  25.76 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  25.76 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  25.76 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.43 
 
 
314 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  25.11 
 
 
307 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  22.37 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  25.76 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  25.4 
 
 
405 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  25.76 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  25.76 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.44 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  25.11 
 
 
307 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  25.74 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  21.79 
 
 
313 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  25.73 
 
 
284 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  34.43 
 
 
536 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  28.63 
 
 
412 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  25.33 
 
 
284 aa  52  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  25.33 
 
 
284 aa  52  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  23.29 
 
 
307 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  26.49 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  24.66 
 
 
307 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 
359 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  37.59 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  25.24 
 
 
223 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  24.66 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  24.66 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  24.66 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  24.66 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  24.66 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  28.57 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  24.2 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  26.47 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  26.47 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  26.47 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  25.93 
 
 
317 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  27.69 
 
 
294 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
274 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  25.76 
 
 
282 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.07 
 
 
259 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  29.44 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
302 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  25.1 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.27 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  29.49 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  26.52 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
330 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  24.66 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  33.64 
 
 
533 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  19.71 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  27.51 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>