27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6175 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6175  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  531  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  48.26 
 
 		 254 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6824  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  52.55 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  52.08 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  50.85 
 
 		 339 aa  161  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0444  hypothetical protein  59.15 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  46.43 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  43.56 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4984  peptidase S15  45.31 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0292  putative hydrolase  41.05 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  32.26 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  28.89 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.9 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  38.96 
 
 		 467 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  26.6 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.16 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  26.29 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  25.55 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  32.5 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  24.4 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1656  secreted protein  30.34 
 
 		 425 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000081401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  41.51 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  32 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 342 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  25.38 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>