113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6824 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6824  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  100 
 
 
283 aa  554  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4984  peptidase S15  55.13 
 
 
266 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  52.56 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  47.62 
 
 
255 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  48.26 
 
 
263 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6175  hypothetical protein  52.55 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  44.94 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0292  putative hydrolase  45.58 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  41.11 
 
 
265 aa  152  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0444  hypothetical protein  39.11 
 
 
287 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  29.17 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  29.33 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  28.93 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  28.21 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  28.12 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  26.18 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  30.43 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25.79 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  26.79 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  25.75 
 
 
337 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  28.44 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  27.02 
 
 
467 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  27.56 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.78 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  30.83 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  32.51 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  29.89 
 
 
312 aa  56.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  30.85 
 
 
253 aa  55.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.21 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  27.12 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  27.47 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  33.04 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.21 
 
 
280 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.16 
 
 
264 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  30.93 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  23.58 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.58 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.03 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
244 aa  49.3  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  27.63 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  24.34 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  23.45 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  43.75 
 
 
286 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  29.87 
 
 
276 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  32.47 
 
 
314 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.23 
 
 
314 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  33.61 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 
275 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  27.93 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3869  hypothetical protein  23.53 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  22.18 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  22.77 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  30.87 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  22.51 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  22.77 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  44.78 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  34.65 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
394 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  23.33 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3058  Prolyl aminopeptidase  37.6 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  25.53 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  25.13 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  38.41 
 
 
341 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.71 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  22.32 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  32.03 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  31.03 
 
 
217 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  29.06 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  20.63 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  26.27 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.05 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  22.32 
 
 
319 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  30 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  23.33 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.73 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  35.34 
 
 
300 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  28.69 
 
 
345 aa  42.7  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  25.17 
 
 
325 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>