66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0292 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0292  putative hydrolase  100 
 
 
263 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  61.75 
 
 
265 aa  308  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  50.21 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  50.42 
 
 
255 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7972  hypothetical protein  50 
 
 
263 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  45.56 
 
 
339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6824  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  45.58 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4984  peptidase S15  41.94 
 
 
266 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6175  hypothetical protein  41.05 
 
 
279 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0444  hypothetical protein  32.16 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  27.5 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  25.55 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  32.6 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  29.3 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  27.59 
 
 
312 aa  62.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  27.95 
 
 
313 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  27.85 
 
 
294 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.79 
 
 
315 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  26.41 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.19 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  26.27 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  26.1 
 
 
306 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  27.62 
 
 
405 aa  52  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.4 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.62 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.49 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  26.72 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.32 
 
 
296 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  28.15 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  25.79 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  29.38 
 
 
410 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  28.17 
 
 
467 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  38.64 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.14 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  26.23 
 
 
322 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  38.64 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  38.64 
 
 
319 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  38.64 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  22.04 
 
 
307 aa  45.8  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  38.64 
 
 
319 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  38.64 
 
 
319 aa  45.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  37.84 
 
 
301 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  28.44 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  31.58 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  26.11 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  27.59 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  24.68 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  31.67 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
323 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  28.39 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  38.3 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  40 
 
 
293 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  40 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  40 
 
 
293 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  32.69 
 
 
317 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  38.3 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  38.3 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  38.3 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  28.5 
 
 
322 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  38.3 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  46.15 
 
 
314 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>