126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2612 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  96.49 
 
 
313 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  35.97 
 
 
308 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  34.65 
 
 
307 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  34.98 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  34.65 
 
 
307 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  34.65 
 
 
307 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  34.65 
 
 
307 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  34.65 
 
 
307 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  34.65 
 
 
307 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  34.44 
 
 
307 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  34.32 
 
 
307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  32.45 
 
 
307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  32.73 
 
 
306 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  31.03 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  31.66 
 
 
319 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.08 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  35.34 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  33.73 
 
 
319 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  34.94 
 
 
300 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  35.36 
 
 
337 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  34.14 
 
 
319 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  34.48 
 
 
319 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  30.55 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  29.37 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  34.46 
 
 
337 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  28.85 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  32.18 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  30.69 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  31.07 
 
 
307 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  29.38 
 
 
317 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  28.39 
 
 
313 aa  122  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  27.8 
 
 
345 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  24.22 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  31.08 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  27.62 
 
 
312 aa  95.9  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0215  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.68 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000127658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  26.69 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl606  putative hydrolase  27.2 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  26.24 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.71 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  30 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  25.1 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.75 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.71 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.31 
 
 
280 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  21.12 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  28.74 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl315  lysophospholipase  28.76 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.71518e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.53 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14054  predicted protein  23.55 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  32.91 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.89 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  21.37 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25.63 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl390  hydrolase  29.58 
 
 
324 aa  62.8  0.000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0649986  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  25.46 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0822  hypothetical protein  26.91 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  21.83 
 
 
424 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  24.24 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  23.25 
 
 
256 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  21.89 
 
 
314 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  24.07 
 
 
284 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  22.31 
 
 
292 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  24.07 
 
 
284 aa  59.3  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  23.7 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  23.7 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  23.7 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  22.66 
 
 
254 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  28.24 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  23.7 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  23.7 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  23.7 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  23.7 
 
 
284 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  24.45 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  25.09 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  22.9 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  24.39 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  22.34 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  22.37 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  21.46 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  21.78 
 
 
294 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  24.34 
 
 
314 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  20.4 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  27.64 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  21.25 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  21.25 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  21.25 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.15 
 
 
652 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  22.35 
 
 
285 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  23.53 
 
 
294 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  22.17 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.86 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  23.53 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.35 
 
 
631 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  22.35 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>