98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1554 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 359 aa  706    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3405  alpha/beta hydrolase fold  80.28 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0644  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  41.99 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.283453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3176  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  39.83 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  28.87 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  29.24 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.52 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  26.39 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  29.24 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  26.59 
 
 		 236 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.28 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  25.19 
 
 		 255 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  23.6 
 
 		 254 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 279 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  25.22 
 
 		 277 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.07 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  25.1 
 
 		 255 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  21.72 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.75 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  22.96 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.85 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  27.03 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  21.46 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.47 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  25 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  25.18 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 		 263 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 272 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  22.39 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  22.03 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 267 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  24.64 
 
 		 268 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 275 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 271 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.89 
 
 		 474 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  25.45 
 
 		 390 aa  46.2  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2293  hypothetical protein  26.45 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.661266  normal  0.0651715 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.17 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1329  hypothetical protein  27.57 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.34 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  24 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  22.08 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.17 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  23.34 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  23.61 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  26.36 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  29.25 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1715  dienelactone hydrolase  31.11 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.352882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.23 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.15 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.74 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  21.99 
 
 		 269 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  26.91 
 
 		 258 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.3 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  33.04 
 
 		 302 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 260 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 270 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.63 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 270 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  22.69 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.28 
 
 		 266 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.1 
 
 		 260 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  23.05 
 
 		 273 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  19.93 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  24.02 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41254  predicted protein  23.98 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.69 
 
 		 270 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  23.71 
 
 		 448 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.1 
 
 		 260 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  27.27 
 
 		 259 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  27.63 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.1 
 
 		 282 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  27.48 
 
 		 294 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 256 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.77 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  34.25 
 
 		 263 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  28.87 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  25.29 
 
 		 259 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>