122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3405 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3405  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 357 aa  707    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  80 
 
 		 359 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0644  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  41.6 
 
 		 364 aa  222  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.283453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3176  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 356 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  36.44 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  28.07 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  28.57 
 
 		 255 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  28.57 
 
 		 255 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.51 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  24.48 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  23.44 
 
 		 299 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.36 
 
 		 270 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 270 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 254 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.7 
 
 		 262 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  25.27 
 
 		 268 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.3 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.36 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.75 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  26.25 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.83 
 
 		 285 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.14 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  34.78 
 
 		 278 aa  49.7  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.22 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 286 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  32 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  23.65 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  22.77 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  25.95 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 263 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  27.85 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  24.39 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  25.39 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  24.6 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  25.48 
 
 		 236 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  20.65 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 279 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.18 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  32.56 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  20.74 
 
 		 288 aa  47  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 256 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0662  alpha/beta fold family hydrolase  20.21 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.212326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 279 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 266 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 254 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  24.07 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2492  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149577  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  25.51 
 
 		 269 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41254  predicted protein  25 
 
 		 284 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  39.36 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  23.55 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  28.64 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  23.86 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.64 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.72 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  26.29 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  24.4 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  21.31 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  21.24 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.19 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  27.98 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  29.29 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.18 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.18 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  36.25 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  26.58 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.88 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  22.22 
 
 		 265 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  23.38 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4984  peptidase S15  25.56 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2293  hypothetical protein  21.95 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.661266  normal  0.0651715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  38.1 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  25.13 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  24.89 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>