42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2293 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2293  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.661266  normal  0.0651715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  46.63 
 
 
236 aa  195  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1329  hypothetical protein  32.13 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  38.27 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  39.13 
 
 
277 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.63 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  30 
 
 
276 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  34.44 
 
 
326 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  31.25 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  31.25 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
359 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  30.83 
 
 
283 aa  45.1  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  31.91 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  32.65 
 
 
363 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0644  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  33.04 
 
 
364 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.283453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.7 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
267 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  26.71 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  31.09 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  27.78 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
271 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  33.7 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3405  alpha/beta hydrolase fold  21.95 
 
 
357 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  28.85 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  28.7 
 
 
270 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.71 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  28.7 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  27.27 
 
 
326 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
270 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
254 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  33.33 
 
 
390 aa  42.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  25.19 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
271 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  29.9 
 
 
298 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  29.21 
 
 
323 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  29.73 
 
 
258 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.51 
 
 
297 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  23.33 
 
 
305 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  32.11 
 
 
252 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
344 aa  42  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1048  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.93 
 
 
316 aa  41.6  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>