38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5516 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  100 
 
 		 323 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  69.62 
 
 		 298 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  66.15 
 
 		 289 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  60.82 
 
 		 311 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  68.46 
 
 		 304 aa  345  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  63.12 
 
 		 301 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  63.85 
 
 		 292 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  62.36 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  67.7 
 
 		 285 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  52.32 
 
 		 319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  58.71 
 
 		 295 aa  295  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  44.7 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  45.08 
 
 		 468 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  24.9 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  26.32 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.26 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  29.52 
 
 		 430 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.34 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  27.54 
 
 		 417 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  27.43 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  25.54 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  32.81 
 
 		 1010 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  26.55 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  30.84 
 
 		 464 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.01 
 
 		 568 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  25.66 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  25.66 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  22.27 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  31.58 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  22.27 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  33.04 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  32.08 
 
 		 449 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  34.31 
 
 		 468 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  31.96 
 
 		 417 aa  43.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  27.94 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  25.13 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  31.96 
 
 		 417 aa  42.7  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>