31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_27960  cutinase  100 
 
 
304 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  66.03 
 
 
319 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  68.46 
 
 
323 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  65.27 
 
 
301 aa  364  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  66.17 
 
 
298 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  60.26 
 
 
311 aa  345  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  63.22 
 
 
292 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  62.31 
 
 
289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  63.08 
 
 
285 aa  301  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  53.57 
 
 
319 aa  301  9e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  55.89 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  44.49 
 
 
472 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  44.4 
 
 
468 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.37 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  22.22 
 
 
464 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  25.77 
 
 
305 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  24.12 
 
 
305 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  35.51 
 
 
501 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  22.86 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  22.64 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  20.88 
 
 
430 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  24.12 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  24.12 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  21.56 
 
 
433 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  24.68 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  32.99 
 
 
316 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  25 
 
 
378 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  30.16 
 
 
1010 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.35 
 
 
370 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  23.74 
 
 
312 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>