38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0390 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  100 
 
 
292 aa  597  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  79.17 
 
 
289 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  65.12 
 
 
298 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  63.94 
 
 
311 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  64.15 
 
 
323 aa  347  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  61.11 
 
 
301 aa  341  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  60.74 
 
 
319 aa  338  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  66.67 
 
 
285 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  62.88 
 
 
304 aa  322  6e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  54.23 
 
 
319 aa  304  9.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  59.02 
 
 
295 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  48.18 
 
 
472 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  48.35 
 
 
468 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  27.27 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  28.23 
 
 
313 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25 
 
 
430 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  26.92 
 
 
338 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  29 
 
 
406 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  32.46 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  26.59 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.7 
 
 
370 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  24.09 
 
 
285 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  24.07 
 
 
254 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  28.28 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  24.02 
 
 
568 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  28.1 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  29.82 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  26.86 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  32.32 
 
 
345 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  31.91 
 
 
347 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.31 
 
 
347 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  31.3 
 
 
7149 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.08 
 
 
426 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  26.52 
 
 
384 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  29.25 
 
 
343 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  31.07 
 
 
365 aa  42.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  23.89 
 
 
410 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>