44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4588 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  100 
 
 
311 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  67.94 
 
 
323 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  63.71 
 
 
292 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  65.17 
 
 
298 aa  352  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  60.22 
 
 
319 aa  346  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  59.11 
 
 
301 aa  340  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  63.18 
 
 
289 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  58.55 
 
 
319 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  62.26 
 
 
285 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  60.36 
 
 
304 aa  298  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  56.62 
 
 
295 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  44.03 
 
 
472 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  44.06 
 
 
468 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.06 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  24.77 
 
 
430 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  26.55 
 
 
410 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  24.55 
 
 
464 aa  49.3  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.83 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.69 
 
 
370 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.11 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  24.86 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.86 
 
 
751 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  25.15 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  32 
 
 
501 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  26.64 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.63 
 
 
771 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  30.63 
 
 
763 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  30.63 
 
 
763 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.63 
 
 
767 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  35.56 
 
 
316 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  29.23 
 
 
1010 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  26.8 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.78 
 
 
768 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
514 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  28.87 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  20.86 
 
 
433 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  18.22 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  28.57 
 
 
348 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
281 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  28.74 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  28.57 
 
 
348 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.73 
 
 
760 aa  42.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  29.51 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  23.93 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>