34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5476 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  43.01 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  33.21 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  33.8 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  32.09 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  32.17 
 
 		 406 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20370  hypothetical protein  28.33 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0877904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  30.7 
 
 		 417 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  29.24 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  28.8 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  28.75 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  30.94 
 
 		 756 aa  85.5  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  30.4 
 
 		 567 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  28.19 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.89 
 
 		 568 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  30 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  27.94 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  33.33 
 
 		 547 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  26.59 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  23.78 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  28.71 
 
 		 472 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  26.96 
 
 		 533 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  27.12 
 
 		 319 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  31.78 
 
 		 607 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  27.43 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  27.64 
 
 		 551 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02789  conserved hypothetical protein  24.03 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  28.9 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  46.81 
 
 		 713 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  27.68 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  24.1 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.85 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  22.96 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  31 
 
 		 298 aa  42  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>