14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2984 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  587  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  69.06 
 
 
281 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20370  hypothetical protein  64.41 
 
 
284 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0877904  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  54.41 
 
 
756 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  41.69 
 
 
295 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02789  conserved hypothetical protein  43.03 
 
 
328 aa  203  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  29.24 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  32.18 
 
 
280 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  30.39 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  31.94 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  30.23 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  25.9 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  23.41 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  23.48 
 
 
406 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>