14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2700 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  74.39 
 
 
285 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20370  hypothetical protein  65.36 
 
 
284 aa  371  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0877904  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  47.65 
 
 
756 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  43.43 
 
 
295 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02789  conserved hypothetical protein  46.03 
 
 
328 aa  205  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  28.75 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  32.18 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  31.86 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  30.66 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  26.89 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.59 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  23.14 
 
 
406 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  28.31 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>