33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4204 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  43.95 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  36.36 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  34.54 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  33.48 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  30.67 
 
 		 417 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20370  hypothetical protein  30.28 
 
 		 284 aa  95.5  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0877904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  32.81 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  32.48 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  30.8 
 
 		 756 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  29.62 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  24.26 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  27.53 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  27.08 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  25.31 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  25.22 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  25.77 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.97 
 
 		 567 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  25.85 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  25.44 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  25.91 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.27 
 
 		 568 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  29.91 
 
 		 547 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  39.19 
 
 		 607 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02789  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 328 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  27.54 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  28 
 
 		 472 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  23.44 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  29.52 
 
 		 551 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  29.29 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  28.57 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>