21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2249 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  609  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20370  hypothetical protein  46.64 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0877904  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  43.94 
 
 
281 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  43.01 
 
 
285 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  41.29 
 
 
756 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02789  conserved hypothetical protein  39.06 
 
 
328 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  33 
 
 
417 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  28.8 
 
 
279 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  29.62 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  23.98 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  25.53 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.6 
 
 
369 aa  48.9  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  25.55 
 
 
285 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  28.93 
 
 
572 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  26.92 
 
 
406 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  28.74 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.61 
 
 
393 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  28.93 
 
 
572 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.68 
 
 
567 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  24.23 
 
 
369 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  31.82 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>