15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20370 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20370  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  583  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0877904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  70.61 
 
 		 281 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  67.06 
 
 		 285 aa  362  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  54.29 
 
 		 756 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  45.8 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02789  conserved hypothetical protein  47.06 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  33.49 
 
 		 417 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  28.4 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  30.28 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  31.43 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  30.36 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  26 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.59 
 
 		 369 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  29.17 
 
 		 406 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  25.13 
 
 		 567 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>