18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0428 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  839    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  35.68 
 
 
286 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  31.43 
 
 
280 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20370  hypothetical protein  32.71 
 
 
284 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0877904  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  30.7 
 
 
279 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  33 
 
 
295 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  30.39 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  33.64 
 
 
756 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  31.02 
 
 
281 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  28.42 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  29.77 
 
 
285 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2362  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 
491 aa  73.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  27.7 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  28.57 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  28.33 
 
 
323 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  24.86 
 
 
298 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  27.43 
 
 
292 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  25.85 
 
 
319 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>