19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  823    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  32.56 
 
 
279 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  26.5 
 
 
286 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  28.26 
 
 
313 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  24.26 
 
 
280 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  28.37 
 
 
289 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  25.49 
 
 
285 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  27.7 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  31.11 
 
 
319 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  29 
 
 
292 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  23.14 
 
 
281 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  27.35 
 
 
295 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  29.44 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.04 
 
 
546 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  28.16 
 
 
568 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0043  hypothetical protein  27.4 
 
 
1808 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  23.48 
 
 
285 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.42 
 
 
567 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.97 
 
 
568 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>