39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1278 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  100 
 
 
289 aa  590  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  82.24 
 
 
292 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  66.67 
 
 
323 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  65.79 
 
 
298 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  63.21 
 
 
311 aa  345  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  61.34 
 
 
301 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  60.97 
 
 
319 aa  338  5e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  66.93 
 
 
285 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  62.26 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  61.62 
 
 
295 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  54.23 
 
 
319 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  45.08 
 
 
472 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  46.72 
 
 
468 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  26.84 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.15 
 
 
430 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  26.03 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  28.19 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  28.57 
 
 
417 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  24.34 
 
 
568 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  28.37 
 
 
406 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  24.5 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.34 
 
 
338 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  27.35 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  31.09 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  26.2 
 
 
410 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.91 
 
 
370 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  22.34 
 
 
449 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  30 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.82 
 
 
372 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.67 
 
 
426 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  30.3 
 
 
347 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  42.47 
 
 
324 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  21.22 
 
 
380 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  42.47 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  23.01 
 
 
305 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.67 
 
 
393 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  32.58 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  32.04 
 
 
365 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>