75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3190 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  87.35 
 
 
324 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  79 
 
 
319 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  65.5 
 
 
322 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  60.39 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  59.74 
 
 
309 aa  348  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  52.78 
 
 
322 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  55.88 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  50.66 
 
 
318 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  51.46 
 
 
308 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  45.52 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.92 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.07 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  36.13 
 
 
568 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  27.19 
 
 
607 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.33 
 
 
361 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  24.55 
 
 
565 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.67 
 
 
569 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  27.96 
 
 
526 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  23.47 
 
 
543 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.37 
 
 
546 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  28.95 
 
 
567 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.44 
 
 
464 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.99 
 
 
430 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  35.04 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  31.4 
 
 
572 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.36 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.66 
 
 
567 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  25.87 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  33.06 
 
 
572 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.13 
 
 
382 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  36.36 
 
 
365 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  31.18 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  24.9 
 
 
551 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  29.2 
 
 
449 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  32.5 
 
 
545 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.7 
 
 
568 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  24 
 
 
547 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  32.52 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  31.75 
 
 
601 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  23.89 
 
 
600 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.01 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  23.89 
 
 
600 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  35.4 
 
 
328 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  26.18 
 
 
533 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  26.42 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  28.57 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.33 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  31.21 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  22.56 
 
 
406 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  27.27 
 
 
456 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  33.6 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.85 
 
 
505 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  37.1 
 
 
352 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  29.12 
 
 
319 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  24.68 
 
 
318 aa  45.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  32.03 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  26.36 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  26.36 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  27.27 
 
 
456 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  35.45 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  29.17 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  26.89 
 
 
449 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  32.43 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  28.35 
 
 
675 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.35 
 
 
675 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  32.26 
 
 
369 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  23.77 
 
 
605 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  28.06 
 
 
369 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.76 
 
 
393 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  26.17 
 
 
713 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  46.51 
 
 
474 aa  42.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.56 
 
 
680 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  27.81 
 
 
407 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>