189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1212 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 344 aa  692    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4277  alpha/beta hydrolase fold  48.86 
 
 		 333 aa  288  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  40.14 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1860  Alpha/beta hydrolase  38.61 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3696  alpha/beta hydrolase  34.36 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3419  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.516621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.3 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  27.13 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.23 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  36.05 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  36.05 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  33.72 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 324 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 290 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  26.27 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1899  lysophospholipase-like protein  27.4 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  31.58 
 
 		 482 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.13 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  33.72 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  33.72 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  33.72 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  36.05 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  33.72 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  28.64 
 
 		 289 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 248 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  33.72 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  33.72 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 279 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  29.63 
 
 		 487 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 297 aa  50.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  31.48 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  26.2 
 
 		 424 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  21.83 
 
 		 298 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  27.52 
 
 		 324 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.23 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  41.38 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  31.37 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 372 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  36.36 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  28.19 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  24.82 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  25.62 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  25.62 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  25.62 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  31.54 
 
 		 493 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.23 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  29.63 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  24.61 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0172  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.34441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  26.81 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  21.17 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  30.93 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  25.87 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  26.03 
 
 		 326 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  27.54 
 
 		 487 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 306 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  20.82 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  33.05 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  29.41 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  32.26 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13201  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  35.42 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  32.26 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>