139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5871 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 309 aa  606  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  56.58 
 
 		 345 aa  325  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  55.59 
 
 		 345 aa  321  8e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  49.84 
 
 		 321 aa  291  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  48.7 
 
 		 318 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  49.38 
 
 		 339 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  48.12 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  47.19 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  49.37 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  48.46 
 
 		 335 aa  254  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  49.35 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  50.79 
 
 		 331 aa  248  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  46.06 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  42.72 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  43.93 
 
 		 369 aa  222  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  44.59 
 
 		 320 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  42.81 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  42.81 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  42.81 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  41.12 
 
 		 341 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  44.98 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  44.15 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  39.81 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  38.78 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  43.77 
 
 		 346 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.67 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  43.63 
 
 		 353 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  43.56 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  36.52 
 
 		 361 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  42.57 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  40.74 
 
 		 332 aa  195  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  42.39 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  40.65 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  36.48 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  39.16 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  32.92 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  38.03 
 
 		 369 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  44 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.68 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.05 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  21.17 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  29.31 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.11 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  32.05 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  30.47 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 		 559 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  36.44 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  27.27 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  27.27 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43400  predicted protein  22.03 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.21528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  30.77 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  22.59 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  25.09 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.87 
 
 		 357 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  19.4 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  21.32 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  29.94 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  25.16 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  21.59 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  29.29 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  20.41 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  19.71 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  23.42 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.34 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  31.67 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  24.2 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  22.32 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  24.05 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>