81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1558 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  788    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  58.18 
 
 
332 aa  352  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  55.21 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  55.21 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  55.21 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  52.42 
 
 
353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  53.99 
 
 
346 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  51.37 
 
 
346 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  51.92 
 
 
340 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  44.11 
 
 
339 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  46.06 
 
 
309 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  45.17 
 
 
323 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  45.22 
 
 
330 aa  235  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  45.79 
 
 
353 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  44.09 
 
 
321 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  44.74 
 
 
345 aa  229  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  45.89 
 
 
345 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.62 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  41.12 
 
 
335 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  42.06 
 
 
340 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  42.38 
 
 
369 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  38.1 
 
 
361 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.54 
 
 
318 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  39.7 
 
 
341 aa  201  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  40.8 
 
 
332 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  43.26 
 
 
361 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.56 
 
 
345 aa  195  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  41.32 
 
 
337 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  39.34 
 
 
336 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  39.43 
 
 
369 aa  186  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  41.34 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  42.14 
 
 
313 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  37.76 
 
 
354 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.76 
 
 
331 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  39.62 
 
 
341 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  36.96 
 
 
320 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  34.19 
 
 
335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  38.91 
 
 
341 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  33.92 
 
 
334 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  34 
 
 
280 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  31.88 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  24.73 
 
 
277 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  25.62 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  32 
 
 
336 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2844  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  26.17 
 
 
279 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  35 
 
 
286 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  28.97 
 
 
279 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  28.97 
 
 
279 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  24.92 
 
 
332 aa  49.7  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  28.97 
 
 
279 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
279 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 
280 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  25.96 
 
 
316 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 
280 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  37.4 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  34.82 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.45 
 
 
277 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  34.41 
 
 
279 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
263 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
559 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
294 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0017  Lysophospholipase-like protein  29.66 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  31.53 
 
 
278 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  21.07 
 
 
333 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0068  Alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
375 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
328 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 
313 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  32.98 
 
 
343 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
275 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>