111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0569 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  720    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  42.17 
 
 
339 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  42.28 
 
 
323 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  40.49 
 
 
331 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  40.18 
 
 
335 aa  206  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  39.68 
 
 
337 aa  202  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  39.88 
 
 
345 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  39.22 
 
 
345 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  38.87 
 
 
318 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  38.72 
 
 
340 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  39.27 
 
 
353 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  40.65 
 
 
309 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  37.69 
 
 
369 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  38.91 
 
 
313 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  35.58 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  37.11 
 
 
321 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  37.76 
 
 
398 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  37.95 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  37.95 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  37.95 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  33.13 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  34.89 
 
 
330 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  33.23 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  37.58 
 
 
346 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  33.79 
 
 
334 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  36.39 
 
 
340 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 
341 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  34.15 
 
 
332 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 
320 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 
332 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  38.55 
 
 
341 aa  153  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  35.25 
 
 
345 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  33.9 
 
 
353 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  33.13 
 
 
346 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  30.11 
 
 
361 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  33.13 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  35.45 
 
 
361 aa  129  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  31.46 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  31.64 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  22.65 
 
 
338 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  26.46 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  23.39 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.85 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
302 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  21.72 
 
 
329 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  25.77 
 
 
338 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  25.77 
 
 
338 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  25.77 
 
 
338 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  25.77 
 
 
338 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  25.77 
 
 
338 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
290 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
290 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  33.91 
 
 
286 aa  50.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
288 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  29.27 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  30.1 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  21.8 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  23.57 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  34.35 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  34.35 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  34.35 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  34.35 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  34.35 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
277 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  38.82 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  34.35 
 
 
280 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  34.35 
 
 
280 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  20.34 
 
 
333 aa  46.2  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1860  Alpha/beta hydrolase  29.38 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
279 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  34.58 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  30.33 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0009  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
584 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  24.23 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  24.5 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  31.3 
 
 
306 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
289 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3659  hypothetical protein  27.61 
 
 
583 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962134  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  28.37 
 
 
589 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  26.5 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  33.04 
 
 
284 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
273 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04046  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03890)  31.62 
 
 
491 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.778204 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
275 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  31.9 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
589 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
589 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>