More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4119 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  93.51 
 
 
329 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
337 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  99.11 
 
 
337 aa  700    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
337 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  87 
 
 
327 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  87 
 
 
327 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  86.69 
 
 
327 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  87 
 
 
327 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  84.88 
 
 
327 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  60.7 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  61.02 
 
 
324 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  59.09 
 
 
329 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  55.73 
 
 
330 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  52.22 
 
 
324 aa  359  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  56.81 
 
 
317 aa  345  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  51.1 
 
 
329 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  40.94 
 
 
322 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  42.09 
 
 
338 aa  235  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  39.74 
 
 
329 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  39.23 
 
 
331 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  39.23 
 
 
337 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  40.26 
 
 
335 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  39.29 
 
 
345 aa  222  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  38.59 
 
 
331 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  39.23 
 
 
330 aa  221  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  37.38 
 
 
322 aa  221  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  37.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  37.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  37.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  37.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  37.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  37.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  37.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  37.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  37.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  36.84 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  36.84 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  36.84 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  36.98 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  36.84 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  36.84 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  36.01 
 
 
345 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  36.45 
 
 
331 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  37.39 
 
 
334 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
364 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  35.09 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  34.8 
 
 
638 aa  195  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  33.68 
 
 
318 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
314 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 
315 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  35.03 
 
 
344 aa  136  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  36.11 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
314 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 
324 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  31.62 
 
 
330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  34.7 
 
 
333 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
315 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  35.09 
 
 
324 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  32.41 
 
 
331 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  32.41 
 
 
331 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  28.81 
 
 
320 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
314 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  32.76 
 
 
332 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  28.17 
 
 
329 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
317 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 
320 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
345 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  30.6 
 
 
317 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
320 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  30.66 
 
 
363 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
314 aa  99.4  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  28.36 
 
 
330 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
277 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  27.36 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.73 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  28.73 
 
 
288 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  26.16 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  25.48 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>