180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0245 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  100 
 
 
330 aa  682    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  76.36 
 
 
330 aa  524  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  72.19 
 
 
345 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  67.78 
 
 
345 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  69.04 
 
 
345 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  62.2 
 
 
337 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  64.06 
 
 
331 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  63.75 
 
 
331 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  61.76 
 
 
340 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  61.76 
 
 
340 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  61.76 
 
 
340 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  61.76 
 
 
340 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  61.76 
 
 
340 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  61.76 
 
 
340 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  61.76 
 
 
340 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  61.76 
 
 
340 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  61.76 
 
 
340 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  57.37 
 
 
338 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  57.37 
 
 
338 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  57.05 
 
 
338 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  57.37 
 
 
338 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  58.44 
 
 
331 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  57.37 
 
 
338 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  42.14 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  40.19 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  39.87 
 
 
327 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  39.87 
 
 
327 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  39.87 
 
 
327 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 
337 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 
337 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 
337 aa  221  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  39.62 
 
 
329 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  38.39 
 
 
329 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  36.74 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  34.43 
 
 
333 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  35.18 
 
 
324 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  37.15 
 
 
335 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  35.2 
 
 
322 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  38.15 
 
 
338 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 
329 aa  203  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  35.5 
 
 
324 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  36 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  35.5 
 
 
638 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 
317 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  34.67 
 
 
330 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
364 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  31.15 
 
 
318 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  34.93 
 
 
315 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  35.99 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 
314 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
323 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
314 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  27.92 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  31.99 
 
 
333 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  32.45 
 
 
330 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  31.86 
 
 
331 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  31.86 
 
 
331 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
330 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
330 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  29.77 
 
 
320 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 
324 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
314 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 
314 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  32.08 
 
 
324 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
315 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  30.65 
 
 
332 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  30.59 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
329 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 
333 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  27.92 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
290 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.24 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  29.43 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  24.59 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
567 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  26.61 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
277 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  26.51 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  26.51 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>