79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  100 
 
 		 339 aa  674    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  56.1 
 
 		 335 aa  342  4e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  56.27 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  52.91 
 
 		 323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  52.58 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  50.94 
 
 		 345 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  51.38 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  48.92 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  49.38 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  44.44 
 
 		 316 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  46.27 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  44.48 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  46.93 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  46.13 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  43.07 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  44.71 
 
 		 398 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  42.94 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  43.03 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  39.59 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  43.41 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  43.41 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  43.41 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  43.29 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  42.56 
 
 		 353 aa  212  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  47.87 
 
 		 313 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  41.96 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  42.94 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  42.9 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  36.73 
 
 		 335 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  40.18 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  38.34 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  34.71 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.17 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  36.47 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  35.88 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  35.17 
 
 		 334 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.61 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  35.09 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.43 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  26.83 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  21.17 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  26.12 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  21.68 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  18.71 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  19.42 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  23.46 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.07 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1575  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 461 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  18.97 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  29.38 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  29.17 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  36.78 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  32.56 
 
 		 194 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>