54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2131 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  100 
 
 		 353 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  52.42 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  53.92 
 
 		 340 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  53.92 
 
 		 340 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  53.92 
 
 		 340 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  52.2 
 
 		 346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  51.55 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  50.76 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  50.92 
 
 		 346 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  45.37 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  43.43 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  44.71 
 
 		 323 aa  228  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  43.63 
 
 		 345 aa  225  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  43.95 
 
 		 345 aa  222  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  42.68 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  42.26 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.75 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  43.81 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  42.63 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  38.51 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  38.51 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  36.34 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  40.3 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.16 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  39.12 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  37.17 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  40.2 
 
 		 337 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  37.12 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  34.12 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  38.23 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  37.31 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  33.9 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  36.07 
 
 		 336 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  31.21 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  37.05 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  33.83 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  20.46 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 559 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  33.91 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  33.91 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  22.73 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  33.91 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  33.91 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  33.91 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  33.91 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  33.91 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  32 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  32.63 
 
 		 304 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>